A. 男主角长得像女的漫画
八云滨路——《H2O》
绫崎飒————《旋风管家》
宫小路瑞穗————《少女爱姐姐》
河野亨————《公主公主》
四方谷裕史郎——《公主公主》
丰实琴——《公主公主》
布里吉特————《罪恶装备》
PICO————《女装正太》
斋藤步————《紫音之王》
真————《南家三姐妹》
白--《火影忍者》
冲田总司--《新撰组异闻录》
一之宫真央罗-----《绅士同盟》
柚木梓马--《金色琴弦》
花月——《闪灵二人组》
天川泉——《Kirarin revolution》
藤咲抚子/藤咲凪彦——《守护甜心》
藤守直——《喜欢就喜欢》
提耶利亚·厄德——《机动战士高达00》
葵双叶——《逮捕令》
结城萤——《萌菌物语》
柳宿——《不思议游戏》
天和响——《青春草莓蛋》
野村有纪——《同居非男孩》
南野诺维尔——《薄荷关系》
只堂鞠也——《玛丽亚狂热》
白石秋罗——《沉溺爱歌》
柚季晶——《少女少年》
寿圣子——《恋爱情结》
依沙贝拉——《天堂之吻》
绀野藤绪——《我俩的秘密花园》
小思——《小恶魔力争上游》
伽峨觉夜——《杏树学园》
夏尔·凡多姆海伍——《黑执事》
守东桃香——《桃华月惮》
金红石——《人形宫廷乐团》
早乙女阿尔特——《超时空要塞f》
幽鬼丸——《火影忍者》
奈绪（ナオ）——《男生喜欢女仆装》
有纪（ユキ）——《男生喜欢女仆装》
都藻（トモ）——《男生喜欢女仆装》
梨绪（リオ）——《男生喜欢女仆装》
第二类：男变女身（性别改变）
早乙女乱马————《乱马1/2》
大佛弹————《女生爱女生》
上原亮————《我和她的XXX》
吉川惠————《革命之日》
罗兰————《Turn A Gundam》
初芝晃——《恋爱风波》
B. 男主是美少年像女生的动漫
动漫男主是美少年的很多，但是中性的感觉就不太多了。像《新》里的冲田也不能算主角，只能说是重要男配吧~不过很帅很强就是了！
我也不知道楼主看过哪些动漫，也不知道楼主喜欢爱情类、魔幻类，腐女类的，只能想到的列举下了。
男主算中性的有：
《水果篮子》
《隐王》(我觉得这两个主角都算中性呢>_<宵妃啊~不好意思，我激动过头了)
《少年阴阳师》(古装，我觉得男主可以算中性吧……甲斐田雪CV的~）
《钢铁三国志》(古装，持保留态度)
其中，比较伪娘系的是：
《公主公主》（四方谷裕史郎，其实这部还好，不算很伪娘)
《玛丽亚狂热》
《少女爱上姐姐》(= =||)
男配里有中性的：
《鬼眼狂刀》(古装，真田幸村，绪方惠美CV的，虽然眼睛细长但还是很有味道)
《遥远时空中》(古装，永泉，诗纹）
《金色琴弦》(柚木，志水)
《从今开始魔王》
《闪灵二人组》(风鸟院花月)
《全职猎人》(酷拉皮卡)
《07-GHOST》(这个欧式的算古装么，拉普拉多鲁)
明年1月会出《薄樱鬼》可是期待一下，也是新撰组题材。
我把近几年的动画全翻了一遍，除了少数我没看的，都写了。毕竟像冲田总司的是可遇不可求的。 LZ说的那种真的很少很少~中性一过头就变娘系了……
C. 找男变女..或者男的长的非常像女人的动漫`要主角的`
少女爱上姐姐:这个绝对符合...第一集因为被外星飞船撞到...而变成女滴了....
乱马:也是变成后素女生...不过和上面不一样..素还能变回来啊...
少年阴阳师:昌浩挺像女生滴..吼吼.....
隐王:里滴壬晴...也很像...不过绝对素恶魔女生啊...
秘密:里滴好象素新吧...超超像女生啊.....
闪灵二人组:里滴花月...怎么看怎么像女滴............
公主公主:三个主角都很像女生....
捉鬼天狗帮:小勘典型滴女生啊....
喜欢就是喜欢:兰.....虽然素男生..可素....好象女人啊...
没有钱:凌濑....女生..女生...超像...
夏目友人帐:夏目满像滴...
驱魔少年:亚伦...优....都素像啊....
D. 动漫里有哪些很像女孩子的男孩子
动漫里很像女孩子的男孩子实在太多了，一一列举的话实在怕是不是字数可以叙述得完的，所以这里我们就单独说一两个角色好了，很像女孩子的男孩子我觉得来自刀剑神域2的桐人了，我想说这个大家应该有印象吧。在刀剑神域第二季中，桐人女装，成了女角色不得不说这个有点稀奇。
女性化的男角色在现在的动漫界中是很容易就看见的，也不知为何，不过话说回来动漫也正是因为有这些稀奇古怪的设定才让其显得精彩。难道不是吗？
E. 有什么动漫男主角看上去很像女生
星野步《架向星空之桥》
夏尔·凡多姆海恩 格雷尔·萨特克里夫《黑执事》
木下秀吉《笨蛋·测试·召唤兽》
绫崎飒《旋风管家》
赤坂龙之介《樱花庄的宠物女孩》
桐谷和人《刀剑神域第二季》
濑能名津流《肯普法》